Prospettive sui metodi di biologia computazionale

Ci sono stati impressionanti progressi nei metodi di calcolo, consentendo ai ricercatori di comprendere meglio i sistemi biologici e fisiologici a livello atomico. Nella sua ultima prospettive in serie Fisiologia Generale, Gazzetta di Fisiologia Generale (JGP) offre uno sguardo in profondità su alcuni di questi metodi ed i vantaggi di ciascuna applicata alle proteine di membrana, con particolare attenzione per i canali ionici. Le prospettive appaiono nel numero di giugno (www.jgp.org).

L’obiettivo principale della biologia computazionale è quello di sviluppare modelli matematici e tecniche computazionali per analizzare meglio i sistemi biologici. Come Guest Editor Benoit Roux (Università di Chicago), spiega, nessun singolo metodo può fornire ai ricercatori di tutti i livelli di descrizione necessaria per esaminare ogni lengthscale pienamente pertinenti ed ai termini di un particolare processo fisiologico. Tuttavia, le quattro prospettive presentate in questo numero mostrano come vari metodi possono essere utilizzati per raggiungere obiettivi diversi.

Le prospettive sono: Denis e Ursula Bucher Rothlisberger (Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne), presente ab initio (principi primi) simulazioni, David Shaw e colleghi (Columbia University) di studiare la dinamica di tutti-atomo molecolare (MD) metodo; Ivet Bahar (Università di Pittsburgh), mostra quanto siano importanti intuizioni possono essere ottenute da ‘corso a grana fine’ (CG) modelli; e Jonathan Silva e Yoram Rudy (Università di Chicago) esaminare una strategia con un piccolo numero di semplificazione ‘stati’ di rappresentare un sistema complesso.

Lo scopo delle prospettive in serie Fisiologia Generale è quello di fornire un forum in corso in cui le questioni scientifiche o controversie possono essere discusse da esperti in modo aperto.

Fonte: Rockefeller University Press

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